Her ilacın olduğu gibi depresyon tedavisinde kullanılan ilaçların da bazı yan etkileri bulunmaktadır. Ancak antidepresan ilaçların ilaçları bırakmayı gerektirecek düzeyde yan etki çıkardıkları seyrek görülmektedir. İlaç ilk başlandığı günlerde görülebilen bazı yan etkiler ise günler geçtikçe ya ortadan kalkmakta ya da rahatsız etmeyecek boyutlara inmektedir.

İlacı bıraktırmayı gerektiren yan etkiler ise çoğu zaman ilaç kesildikten sonra günler içinde tümüyle ortadan kalmaktadır.

Halk arasında psikiyatride kullanılan ilaçların çok zararlı ve kaçınılması gereken ilaçlar olarak görenlerin sayısı azımsanmayacak kadar çoktur. Bu yanlış inanış depresyonlu hastalarının doktora başvurmalarını geciktirebilmekte ve tavsiye edilen ilaçları kullanmasını engelleyebilmektedir.

Oysa günümüzde kullanılmakta olan antidepresan ilaçları kullanan hastaların büyük bir kısmı ilaçları bırakmayı gerektirecek bir yan etki yaşamadan ilacı kullanmaktadırlar..