Günümüzde depresyonun biyolojik nedenleri tam olarak bilinmemekle birlikte depresyonlu hastalarda kullanılan ilaçlardan elde edilen bulgular bazı görüşlerin ileri sürülmesine neden olmuştur.

Depresyonun tedavisinde kullanılan ilaçlar sinir hücreleri arasında iletiyi sağlayan maddelerin ve bu maddelerin hedef bölgesi olan reseptörlerin etkinliğini değiştirmektedirler. Bu bilgiler nörotransmitter olarak adlandırılan bu ileticilerin ve reseptörlerin depresyonun gelişiminde rollerinin olabileceği görüşlerinin ileri sürülmesine yol açmıştır. Depresyonun ortaya çıkmasında rolü olduğu düşünülen en önemli sinir ileticileri arasında noradrenalin, serotonin ve dopamin vardır.

Bazı depresyonlu hastalarda tiroid ve böbreküstü bezi ile ilgili hormonların kan düzeylerinde depresyonu olmayan kişilere göre bazı farklılıklara rastlanması, depresyonun ortaya çıkmasında endokrin sistemlerinin de rolü olabileceğini düşündürmektedir.